1.出题单位不同:全国统考科目的考试大纲由教育部考试中心统一编制，全国联考科目的考试大纲由教育部考试中心或教育部指定相关机构组织编制。
2.考试科目不同：全国统考科目为思想政治理论、英语一、英语二、俄语、日语、数学一、数学二、数学三、教育学专业基础综合、西医综合、中医综合。全国联考科目为数学(农)、化学(农)、植物生理学与生物化学、动物生理学与生物化学、动物生理学与生物化学、计算机学科专业基础综合试题由招生单位自主选择使用)。
3.试卷类型不同：自2013年起，统考的八个专业中的教育学、心理学、计算机、农学和历史学，部分院校不参加专业课统考，所以虽为统考科目，但院校可以不采用统考试卷，自行出卷子。
全国统一考试:是我国现行选拔硕士生的主要办法。它分初试和复试两个阶段进行，初试由各省（区、市）高校招生办公室统一组织实施。初试中部分考试科目由教育部统一命题；对参加复试的初试成绩要求由教育部统一划定，复试由招生单位自行组织并确定录取名单。
全国联考又称“在职人员攻读硕士学位全国联考”，共分两种：一是一月份的统考，又称“一月联考”，政治，英语参加统考，专业课参加全国联考；另一种是十月份，又称“十月联考”，政治由招生学校命题考试，外语，专业课全国联考。